Từ trước đến nay, lĩnh vực y tế dự phòng được Bộ Y tế đánh giá là lĩnh vực có tính chất đặc thù riêng. Trong những năm qua Bộ Y tế đã có nhiều ứng dụng công nghệ thông tin trong mọi lĩnh vực hoạt động của ngành, đó là điều kiện thuận lợi để Cục Y tế dự phòng thực hiện việc ứng dụng công nghệ thông tin một cách mạnh mẽ vào trong hoạt động và đạt được những thành công nhất định. Tuy nhiên, một số những khó khăn, thử thách vẫn tồn tại như về cơ bản ngành Y tế dự phòng các cấp chưa có nhiều ứng dụng công nghệ thông tin.